Single Cell Biotech RACS-Seq

RACS-Seq представляет собой интегрированную систему инструментов, которая объединяет профилирование метаболических явлений отдельных клеток, рамановскую сортировку клеток, подготовку образцов для секвенирования генома отдельных клеток и культивирование отдельных клеток.
Используя технологию рамановской спектроскопии одиночных клеток с меченым стабильным изотопом субстрата, RACS-Seq обеспечивает прямую классификацию видов микроорганизмов и измерение широкого спектра метаболических фенотипов, включая их межклеточную гетерогенность, для отдельных клеток без необходимости в культивации.

В рамках системы RACS-Seq каждая отдельная клетка, отсортированная на основе ее метаболического феномена с помощью оптических пинцетов, может быть инкапсулирована в микрокаплю для амплификации ДНК/РНК одиночной клетки, что позволяет получать библиотеки нуклеиновых кислот с высоким уровнем покрытия и низким уровнем систематической ошибки.
Кроме того, инструмент позволяет сортировать и культивировать отдельные бактериальные клетки в микрокаплях.

Первый коммерческий инструмент для рамановской сортировки и секвенирования одиночных клеток.
Финансируется программой инноваций в области научных приборов CAS и программой развития научного приборостроения NSFC.

Особенности продукта RACS-Seq включают:

- Быстрое многомерное фенотипическое профилирование метаболических явлений без маркировки:
Преимущество рамановской спектроскопии одиночных клеток заключается в отсутствии необходимости маркировки, неразрушающем характере методики и возможности быстрого измерения метаболических фенотипов клеток.
Методику можно дополнить секвенированием отдельных клеток.
Основанная на рамановских спектрах, методика позволяет идентифицировать отдельные виды клеток, анализировать межклеточную гетерогенность и группы метаболических фенотипов по параметрам метаболизма субстрата, синтеза веществ, сетей взаимодействия метаболитов, экологического стресса и межвидовых взаимодействий.

- Точное, быстрое и легкое получение клеток-мишеней с сохранением их активности in situ:
Основанный на запатентованном чипе RAGE, RACS-Seq позволяет легко контролировать траекторию движения отдельных клеток целевых спектров рамановского рассеяния с помощью оптического пинцета, фиксировать их и быстро экспортировать в микрокапли пиколитрового размера.
Это обеспечивает сортировку отдельных функционально активных клеток на основе метаболических признаков по принципу «вы получаете то, что видите».
- Экстракция и амплификация одноклеточной ДНК/РНК с низким уровнем систематической ошибки и высоким охватом последовательностей:
Благодаря запатентованной технологии RAGE-Seq, RACS-Seq значительно снижает погрешность множественной амплификации смещения (MDA).
Покрытие всей последовательности генома одной клетки E. coli может достигать более 90%, что значительно выше по сравнению с контрольной группой (23%), за счет амплификации пиколитровых количеств ДНК одиночных клеток в микрокаплях.