ИАП РАН Нанофор 05

Нанофор 05 - это открытый автоматический генетический анализатор для автоматического определения последовательности ДНК и для проведения фрагментного анализа ДНК.

НАНОФОР 05 является прибором восьмикапиллярного электрофореза с пятицветной лазериндуцированной флуоресцентной детекцией.
Проба — смесь фрагментов ДНК, отличающихся на одно звено, или фрагменты ДНК, полученные методом ПЦР в реальном времени, с помощью автоматизированного устройства позиционирования электрокинетически вводится в капилляр, заполненный раствором геля.
В ходе электрофореза фрагменты ДНК разной длины эффективно разделяются с разрешением в один нуклеотид.
При прохождении через окно детектора происходит возбуждение флуорофора, связанного с молекулой ДНК.
Сигнал флуоресценции детектируется в одном из пяти каналов.
В случае сиквенсных смесей каждый из пяти цветов флуоресценции строго соответствует своему нуклеотиду, а последовательность выхода цветных пиков соответствует последовательности анализируемой ДНК.

Прибор позволяет:
• автоматически заполнять капилляр раствором разделяющего полимера;
• электрокинетически вводить пробу в капилляр из заданной позиции 96-луночного планшета;
• проводить электрофоретическое разделение фрагментов ДНК при контролируемых значениях силы тока, напряжения и температуры;
• детектировать сигнал флуоресценции в пяти каналах 520, 550, 580, 610 и 650 нм;
• проанализировать до 96 образцов без помощи оператора по заданной программе.
Программное обеспечение рассчитано на работу в среде Windows XP и состоит из двух блоков: блок фрагментного анализа и блок анализа нуклеотидной последовательности.
Программное обеспечение позволяет:
• задавать параметры эксперимента;
• визуально контролировать основные параметры в ходе электрофореза;
• проводить анализ полученных данных в ручном и автоматическом режимах;
• иметь доступ к необработанным данным.
Специально для прибора разработаны следующие реактивы:
• разделяющий полимер для фрагментного анализа и для секвенирования;
• наборы для секвенирования со стандартными (М13, T7) праймерами;
• маркеры молекулярного веса ДНК;
• набор для секвенирования с флуоресцентно-меченными терминаторами.

Технические характеристики:

Количество капилляров 8
Формат планшета 96 х 0,2 мл
Количество каналов детекции флуоресценции 7
Лазер твердотельный
Мощность лазера 110 мВт
Длина волны лазера 488 нм
Диапазон напряжения 0,1 – 20 кВ
Диапазон и точность поддержания температуры 30-70 °С (+/- 0,03 °С)
Длина прочтения с точностью не хуже 98,5% до 750 нуклеотидов
Время стандартного фрагментного анализа до 450 нуклеотидов 25 минут
Максимальная анализируемая длина фрагмента ДНК (фрагментный анализ) не менее 1200 нуклеотидов
Габариты, ШхГхВ 630 х 600 х 630 мм
Мощность 300 Вт
Масса не более 50 кг